我們可以根據不同的使用單位來了解這種生物學顯微鏡的用途。根據使用生物顯微鏡單位的不同。主要可以將這些單位分為三種類型，一種是醫療衛生單位，第二種是高等院校，另外一種是一些研究所。在醫療衛生單位當中，生物顯微鏡較大地幫助了醫療衛生單位更好地診斷病情，從而對癥下藥幫助人們更好地解決病痛的困擾，是這種生物學顯微鏡在現實生活當中解決實際問題的典型方面。在一些高校當中，生物學顯微鏡也是非常常見的。特別是對于高校當中的相關專業當中，實驗室往往離不開生物學顯微鏡。高校當中的生物學顯微鏡，幫助培養了相關領域的專業人才，從而推動了社會的發展。在科研事業單位當中，生物學顯微鏡的作用更顯得，它往往被用作探索生物研究的前沿，是推動生物學發展的關鍵。

　　從應用領域的角度來看生物顯微鏡的應用，他主要是被用在以下幾個方面：首先常用于微生物的觀察，微生物包括了一些細菌真菌以及病毒等。我們知道，微生物對于我們現實生活的影響非常巨大，無論是在實際的工業當中，還是與我們人的健康相關，在微生物的研究都是非常有必要的。此外就是對細胞進行研究，這一點的重要性也是勿庸置疑的。另外，生物學顯微鏡還被廣泛地應用在了組織培養，以及一些微小的沉淀物的觀察方面。生物學顯微鏡在這些方面的廣泛應用，較大地促進了人們對微觀世界的了解，不僅推動了微觀學的發展，更推動了整個社會向前推進。